，、，，。
ในลำไส้ของมนุษย์มีจุลินทรีย์หลายล้านล้านตัวอาศัยอยู่ รวมถึงแบคทีเรีย เชื้อรา และไวรัส เรียกรวมว่าไมโครไบโอม โดยจีโนมรวมของสิ่งมีชีวิตเหล่านี้มีขนาดใหญ่กว่าจีโนมมนุษย์มาก
、、，「」。
ไมโครไบโอมที่หลากหลายและมีสุขภาพดีมีส่วนร่วมในการย่อยและดูดซึมอาหาร การสังเคราะห์กรดไขมันสายสั้น การควบคุมการตอบสนองของภูมิคุ้มกัน และการส่งผลต่อระบบประสาทและอารมณ์ผ่าน 'แกนลำไส้-สมอง'
、，、。
การใช้ยาปฏิชีวนะเกินความจำเป็น อาหารแปรรูปสูง และความเครียดเรื้อรังจะทำลายความหลากหลายของไมโครไบโอม และมีความเชื่อมโยงกับโรคลำไส้อักเสบ โรคอ้วน และโรควิตกกังวล
、；。
อาหารที่อุดมด้วยพรีไบโอติก เช่น กระเทียม หัวหอม และข้าวโอ๊ต ช่วยเป็นอาหารให้แบคทีเรียที่เป็นประโยชน์ ส่วนอาหารหมัก เช่น โยเกิร์ตและกิมจิ จะนำเชื้อแบคทีเรียที่มีชีวิตเข้าสู่ร่างกายโดยตรง
，，。
ปัจจุบันการวิจัยด้านไมโครไบโอมเป็นสาขาที่ได้รับความสนใจอย่างมากในวงการชีวการแพทย์ การปลูกถ่ายจุลินทรีย์ในอุจจาระถูกนำมาใช้ในทางคลินิกเพื่อรักษาการติดเชื้อ Clostridium difficile ที่รักษายากและมีแนวโน้มที่สดใส